הספין-אוף החדש של Metroid ל-3DS יתמוך ב-amiibo, Metroid או אחרת.
Nintendo of America חשפה את תאימות ה-amiibo של המשחק עם שני ציוצים. הראשון הראה עבודות צביעה של מריו ו-Bowser, שניתן להשתמש בהן במצב Blast Ball מרובה משתתפים של המשחק.
התאימות של המשחק עם Samus ו-Zero Suit Samus amiibo נשמעת קצת יותר מהותית - נינטנדו מבטיחות 'שדרוגים מועילים במשחק' במהלך הקמפיין.
הסקין של Zero Suit Samus הוא קצת לא מתואר, אבל Samus הרגיל מיוצג כאן היטב.
עניין המעריצים ב- Metroid Prime: Federation Force היה נמוך, למרות שהמפיקים ניסו להבטיח למעריצים שזהחווית Metroid נאותה.
Metroid Prime: כוח הפדרציהמושק ב-3DS ב-19 באוגוסט באמריקה, ב-2 בספטמבר באירופה וב-3 בספטמבר באוסטרליה.